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| 野依动议 |
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作为已成为独立行政法人的理研第一任理事长, 野依良治理事长就任后发表了展示理研研究方针的野依动议。理研依据此动议，不仅为了实现中期目标、中期计划、而且以创建更高层次的研究机关为目标在运营。
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| 1 |
看的见的理研
・提高一般社会对理研的认知度
・研究人员，所员面向社会宣传科学技术的重要性 |
| 2 |
在科学技术史上继续辉煌的理研
・理研的研究精神的继承、发展
・重视研究质量“理研品牌”：非常辉煌的存在
・强化知识产权机能、贡献社会、产业
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| 3 |
充分调动科研人员积极性的理研
・自由的想法，创意
・独自的问题设定
・培养有为的人材 |
| 4 |
对世界和社会发挥作用的理研
・与产业、社会的融合合作
・支持文明社会的科学技术
（大学、产业界所不能的部分） |
| 5 |
对人类文明和文化做出贡献的理研
・提高理研自身的文化度
・重视研究质量“理研品牌”：非常辉煌的存在
・向人文、科学进行情报信息传递 |
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| 研究优先会议 |
为了在全所的经营政策问题上，向理事长提建议，设置了“研究优先会议”。理研内外的有识者对将来研究的方向性和研究的优先性进行讨论。作为惯例会议每月举行１次对设定议题进行讨论。为了开展研究所及研究中心之间、各研究学科间的提携等战略研究，正在推进“战略研究扩大事业”，一年两次进行募集，在研究优先会议上经过严正的学术评价选出课题，课题的研究期间为两年。
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| 理研科学家会议 |
在应该用长远的眼光，开阔的视野来进行研究的领域中，作为理研的研究人员的工作惯例是，在对理事长进行答辩的同时，在个人研究项目向理事会提议的提议会上，由中心负责人，主任研究员，课题组组长等３０名委员进行激烈的讨论。在２００５年度，曾经对“京速计算机”的重要性和研究开发策略进行了答辩活动。
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